Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhdc3Q8VEM9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms