Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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