Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc115Q8VE99 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms