Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms