Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms