Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RttnQ8R4Y8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RttnQ8R4Y8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RttnQ8R4Y8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RttnQ8R4Y8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RttnQ8R4Y8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RttnQ8R4Y8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RttnQ8R4Y8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RttnQ8R4Y8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RttnQ8R4Y8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RttnQ8R4Y8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RttnQ8R4Y8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RttnQ8R4Y8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RttnQ8R4Y8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RttnQ8R4Y8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RttnQ8R4Y8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RttnQ8R4Y8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RttnQ8R4Y8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms