Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CipcQ8R0W1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CipcQ8R0W1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms