Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PolbQ8K409 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms