Protein–RNA interactions for Protein: Q8K368

Fanci, Fanconi anemia group I protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanciQ8K368 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FanciQ8K368 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FanciQ8K368 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FanciQ8K368 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FanciQ8K368 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FanciQ8K368 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FanciQ8K368 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FanciQ8K368 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FanciQ8K368 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FanciQ8K368 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms