Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms