Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H7

Slc45a3, Solute carrier family 45 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a3Q8K0H7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc45a3Q8K0H7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms