Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne5Q8JZW4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms