Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms