Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
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