Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lancl3Q8CD19 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms