Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY8

Dctn4, Dynactin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn4Q8CBY8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dctn4Q8CBY8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms