Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf170Q8CBG9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf170Q8CBG9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rnf170Q8CBG9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rnf170Q8CBG9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf170Q8CBG9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf170Q8CBG9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rnf170Q8CBG9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf170Q8CBG9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf170Q8CBG9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf170Q8CBG9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf170Q8CBG9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf170Q8CBG9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf170Q8CBG9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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