Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slfn5Q8CBA2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms