Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms