Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg4bQ8BGE6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4bQ8BGE6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms