Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms