Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap100Q80VN0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap100Q80VN0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap100Q80VN0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap100Q80VN0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap100Q80VN0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap100Q80VN0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap100Q80VN0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cfap100Q80VN0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cfap100Q80VN0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cfap100Q80VN0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cfap100Q80VN0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cfap100Q80VN0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cfap100Q80VN0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cfap100Q80VN0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cfap100Q80VN0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cfap100Q80VN0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cfap100Q80VN0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cfap100Q80VN0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms