Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc155Q80VJ8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms