Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ttll4Q80UG8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll4Q80UG8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll4Q80UG8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms