Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcdh8Q7TSK3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms