Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms