Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms