Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms