Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TwistnbQ78WZ7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms