Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms