Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms