Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGC7

Slc35e3, Solute carrier family 35 member E3, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35e3Q6PGC7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc35e3Q6PGC7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms