Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms