Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fhod1Q6P9Q4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fhod1Q6P9Q4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms