Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casc4Q6P2L7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms