Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms