Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asic1Q6NXK8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asic1Q6NXK8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asic1Q6NXK8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asic1Q6NXK8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Asic1Q6NXK8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asic1Q6NXK8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asic1Q6NXK8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asic1Q6NXK8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asic1Q6NXK8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Asic1Q6NXK8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asic1Q6NXK8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asic1Q6NXK8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Asic1Q6NXK8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Asic1Q6NXK8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Asic1Q6NXK8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Asic1Q6NXK8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asic1Q6NXK8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Asic1Q6NXK8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Asic1Q6NXK8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Asic1Q6NXK8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asic1Q6NXK8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asic1Q6NXK8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asic1Q6NXK8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asic1Q6NXK8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asic1Q6NXK8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms