Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpsf6Q6NVF9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms