Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms