Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6DFW0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6DFW0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6DFW0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms