Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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