Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk13Q69ZA1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms