Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pan3Q640Q5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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