Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms