Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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