Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox19Q62249 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms