Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Odf1Q61999 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Odf1Q61999 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Odf1Q61999 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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