Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Lrrn1Q61809 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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Lrrn1Q61809 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Lrrn1Q61809 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Lrrn1Q61809 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Lrrn1Q61809 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Lrrn1Q61809 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Lrrn1Q61809 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Lrrn1Q61809 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Lrrn1Q61809 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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