Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Erbb3Q61526 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms