Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd53Q61451 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms